水生植物另一个特征是具有很兴隆的通气组织，莲藕是典型的比如，它的叶柄和藕中有许多孔眼，这就是通气道。孔眼与孔眼相连，相互贯穿形成为一个运送气体的通道网。这样，即使长在不含氧气或氧气短少的污泥中，仍可以生计下来。通气组织还可以增加浮力，坚持身体平衡，这对水生植物也非常有利。水是生命的摇篮。在水生环境中还有种类很多的藻类及各种水草，它们是牲畜的饲料、鱼类的食料或鱼类繁殖的场所。
　　水生植物的细胞空地特别兴隆，常常还发育有特别的通气组织，以确保在植株的水下部分能有满足的氧气。水生植物的通气组织有开放式和封闭式两大类。莲等植物的通气组织归于开放式的，空气从叶片的气孔进入后能通过茎和叶的通气组织，然后进入地下茎和根部的气室。整个通气组织通过气孔直接与外界的空气进行交流。金鱼藻等植物的通气组织是封闭式的，它不与外界大气连通，只储存光合作用发作的氧气供呼吸作用之用，以及呼吸作用发作的二氧化碳供光合作用之用。
　　水生植物的叶面积一般增大，表皮发育微小或在有的情况下几乎没有表皮。沉没在水中的叶片部分表皮上没有气孔，而浮在水面上的叶片外表气孔则常常增多。此外，沉没在水中的叶子同化组织没有栅门组织与海绵组织的分化。水生植物叶子的这些特征都是习气水物种散布中弱光、缺氧的环境条件的成果。水生植物在水中的叶片还常常分裂成带状或丝状，以增加对光、二氧化碳和无机盐类的吸收面积。一起这些非常薄、剧烈分裂的叶片能充沛吸收水体中丰厚的无机盐和二氧化碳。爵床科的水罗兰就是一个典型的比如。它的叶片分为两型叶，水面上的叶片可以实行正常的光合作用的任务，而沉没在水中的、剧烈分裂的叶片还能担负吸收无机盐的任务。
　　由于长期习气于水环境，生活在静水或活动很慢的水体中的植物茎内的机械组织几乎消失。根系的发育非常微小，在有的情况下几乎没有根，主要是水中的叶代替了根的吸收功用，如狐尾藻。